Het inwendige van een bacterie bestaat uit
cytoplasma met onder andere het DNA. Het cytoplasma wordt
omgeven door een celmembraan. Bij de meeste
bacteriesoorten zit hier omheen een celwand op basis van peptidoglycaan. Veel bacteriën kunnen om de celwand nog een
kapsel of een slijmlaag of celenvelop hebben. Bacteriën kunnen verder
uitsteeksels hebben aan de buitenkant in de vorm van flagellen en/of pili.